Ответ:
Видимо, потому что тогда заряд, который «чувствовала» бы альфа-частица, был бы меньше, тогда сила взаимодействия также была бы меньшей.
Хотя мне почему-то кажется, что то, что спрашивается в вопросе, неправда: если в опыте Резерфорда на большие углы отклонялись примерно 0,01% частиц, которые попадали в «маленькое» ядро, то здесь тоже можно весьма удачно «попасть» и отклонится на большой угол, хотя и с меньшей вероятностью.